在功能上，中央空调和新风系统是不重复的。

中央空调是通过制冷制热来调节室内温度的，同时通过湿膜加湿以及除湿来调节室内湿度。

新风系统是利用室内外空气的循环来保证室内空气质量的。很多用户认为家中安装的普通空调也会在墙上打孔，误以为普通空调有通风换气的功能，事实并非如此。普通空调安装在外墙上打孔仅是用于走雪种用，管道里面其实为实心状态，并不能起到通风换气的作用。

在提升生活舒适度上，两者是互补的。

新风系统则是通过引入净化后的室外空气，排出室内污染空气，不断置换循环室内外的空气使室内的氧含量和二氧化碳浓度保持健康的浓度，以至于达到恒氧恒净的效果。

随后，两者相互配合使用能减少机器的损坏率，且会平衡能耗。一个简单的例子，夏天室外温度较高，通过新风系统“全热交换器”进入室内的话，会降低新风温度，从而使得室内中央空调不需要多耗能来降温。